在确定犯罪嫌疑人究竟乘坐了哪趟列车的工作上，沈山铁路上的一个小站——沟帮子站成为了突破口。根据时刻表比对，当时K641次列车在该站的停车时间与当时沟帮子站附近基站显示的目标号码的通话时间最为符合，最终专案组断定，嫌疑人就是乘这趟列车前往沈阳的。
2003年，防范非典是全国的重点工作，对于火车站这样人流量巨大的地点，该工作是重中之重。虽然当时没有现在的大数据技术，但各个车站都会要求旅客填写健康登记卡，专案组立即调取了6月13日K641所有从锦州上车并在沈阳下车的旅客的登记卡信息。
但凡案件早一些或者晚一些发生，都会极大地增加破案难度。当时还没有旅客信息登记系统，车票也是纸质的红色票，倒卖火车票的黄牛猖獗，想要查找一辆列车上的乘客信息可以说是极其困难，在这个案件中，健康登记卡真是立了大功。
