另外,台北故宫拥有国宝中的精品瑰宝。当时运抵台湾的文物共有2,972箱,总计608,985件册。其中清宫档案、善本书籍等图书文献计有567,891件册,器物书画合计63,150件,加上后来征集的文物,至2008年8月底,总计收藏655,713件藏品。
在台北故宫博物院收藏的珍品中,有甲骨2万多片,该院收藏的甲骨数量列世界甲骨收藏机构的第二位;瓷器2万多件,包括原始陶器到明清瓷器,该院的中国古代瓷器是全世界各博物馆中最精、最多的;铜器1万多件,包括历代钱币,其中有商周到春秋战国时期的青铜器4300多件,如商代蟠龙纹盘、兽面纹壶、西周毛公鼎、战国牺尊等;玉器5万多件,其中有著名的新石器时代的玉璧、玉圭、玉璜以及闻名海内外的清代玉雕“翠玉白菜”、“避邪雕刻”、“三镶玉如意”等;书画真迹近1万件,其中有从唐至清历代名家的代表作,如三希堂法帖之一王羲之的《快雪时晴帖》、黄公望的《富春山居图》后部长卷、怀素的《自叙帖》、颜真卿的《刘中使帖》、苏东坡的《寒食帖》等;善本古籍有近2万册,包括中国仅有四部的《四库全书》中较完整的一部;明清档案文献近40万件,其中有清朝历代皇帝硃批奏折、军机处档案、清史馆档、实录、起居注等,以及世界罕见的满文老档40巨册。